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在筛选高价值专利时，会面临多种挑战。比如如何设置科学合理的、可"计算"的指标(体系)并通过使用计算机提高筛选的效率;如何针对中国专利文献的特点提高中国高价值专利筛选的准确性;再比如，技术领域的特殊性如何考虑等等。

除了要面对诸多挑战之外，高价值专利筛选的工作还存在很多难点：

1、专利的价值体现具有滞后性

专利的技术内容具有一定的前瞻性。专利本身从申请到授权再到实际应用往往具有较大的时间跨度。任何一个企业从开始申请专利到逐步转入专利应用有较大的时间跨度，且企业只有在授权专利数达到一定门槛、围绕特定领域进行集中布局后，这些专利才能真正在保护创新成果、遏制竞争对手方面发挥作用。

2、专利的价值体现具有阶段性

以产品专利为例，在产品导入期，申请专利目的是为了获得卡位的优先权，此时专利的主要作用是圈地;在产品成长期，专利的主要作用是形成完善的保护圈，建立专利门槛，甚至形成技术标准，也可以利用质押、证券化等融资手段进行专利资产货币化;在产品成熟期，专利可用来对抗竞争者，进行侵权诉讼、建立专利池、交叉许可等;在产品衰退期，专利可用来进行许可、转让、授权、拍卖等。因此，体现专利价值的"显性"特征具有阶段性的特点。

3、专利的价值体现具有关联性

首先，专利技术之间往往存在技术上的关联，很多情况下，单件专利往往无法单独实施;其次，专利有时候需要与技术秘密相互配合;再者，是否有竞争性的替代技术对目标专利的价值影响也很大;第四，专利的价值还与本领域的技术发展状况密切相关;第五，专利价值的实现程度还与专利拥有者的专利运营能力、专利的主要应用目的及方式等有关。

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